La Fondation canadienne des maladies inflammatoires de l'intestin (FCMII) est un organisme bénévole national sans but lucratif voué à la recherche médicale. Sa mission consiste à trouver un traitement curatif aux maladies inflammatoires de l'intestin. Pour réaliser cette mission, la Fondation s'engage à recueillir des fonds substantiels pour la recherche médicale.

L'éducation fait également partie de son mandat. La Fondation fournit de l'information sur les MII aux personnes atteintes, à leur famille, aux professionnels de la santé et au grand public par l'entremise de brochures d'éducation, du Journal, la publication nationale destinée à ses membres, et des activités d'éducation locales. La FCMII a été créée en 1974 par un groupe de parents inquiets qui observaient le besoin de recueillir des fonds pour la recherche sur les maladies inflammatoires de l'intestin et d'informer les personnes atteintes et leur famille au sujet des MII.